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https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/14315
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
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dc.contributor.author | Olanda, Carolina Gurski | |
dc.date.accessioned | 2023-12-22T02:59:54Z | - |
dc.date.available | 2023-12-22T02:59:54Z | - |
dc.date.issued | 2016-09-30 | |
dc.identifier.citation | OLANDA, Carolina Gurski. Modelagem molecular de novos compostos derivados da Ribavirina como candidatos a fármacos para o controle da dengue. 2016. Dissertação (Mestrado em Modelagem Matemática e Computacional) - Instituto de Ciências Exatas, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica - RJ, 2016. | por |
dc.identifier.uri | https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/14315 | - |
dc.description.abstract | A dengue é uma doença infecciosa causada por um arbovírus, que é transmitido pelo mosquito Aedes aegypti. No Brasil, devido aos períodos chuvosos no verão, é comum a ocorrência de epidemias. Nos últimos anos, o número de casos da doença no país vem crescendo de forma alarmante, aumentando não só a quantidade de registros, mas também o número de óbitos. Até o momento, não há tratamento antiviral que seja efetivo, apenas medidas para a amenização dos sintomas. A enzima viral RNA polimerase dependente de RNA (NS5) exerce papel de grande importância para a replicação viral. Este projeto tem como objetivo o planejamento racional de C-nucleosídeos 1,2,3 triazólicos derivados da ribavirina (1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihidroxi- 5-(hidroximetil)oxolan-2-il]-1H-1,2,4-triazol-3-carboxamida), um potente inibidor da replicação dos flavivírus, inibidores propostos das enzimas NS5. Para se alcançar este objetivo, serão usados os métodos de docking molecular e de cálculos semi-empíricos para o estudo das interações entre os derivados propostos por nosso grupo e as duas enzimas. A realização desse estudo servirá como base para a síntese dos derivados mais promissores, que futuramente poderão levar à criação de um protótipo de um fármaco antiviral, que contribua para o tratamento de todas as formas da dengue, assim como na prevenção da mesma. | por |
dc.description.sponsorship | CAPES | por |
dc.format | application/pdf | * |
dc.language | por | por |
dc.publisher | Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro | por |
dc.rights | Acesso Aberto | por |
dc.subject | Molecular Modeling | eng |
dc.subject | Ribavirin | eng |
dc.subject | Modelagem molecular | por |
dc.subject | Docking | por |
dc.subject | Ribavirina | por |
dc.subject | Dengue | por |
dc.title | Modelagem molecular de novos compostos derivados da Ribavirina como candidatos a fármacos para o controle da dengue | por |
dc.title.alternative | Molecular modeling of new compounds derivatives from Ribavirin as candidates to drugs for dengue control | por |
dc.type | Dissertação | por |
dc.description.abstractOther | Dengue is an infectious disease caused by an arbovirus which is transmitted by the mosquito Aedes aegypti. In Brazil, due to the rainy season in the summer, it is common the occurrence of epidemics. In recent years, the number of cases in the country is growing at an alarming rate, increasing not only the number of records, but also the number of deaths. Until this date, there is no antiviral treatment that is effective, only measures for the sweetening of symptoms. The viral enzyme RNA-dependent RNA polymerase (NS5) plays a role of great importance for viral replication. This project aims to rational planning of C-nucleosides 1,2,3 triazole derivatives of ribavirin (1 - [(2R, 3R, 4S, 5R) -3,4-dihydroxy-5- (hydroxymethyl) dioxolan-2- yl] -1H-1,2,4-triazole-3-carboxamide), a potent inhibitor of the replication of the flavivirus, proposed inhibitors. To achieve this, was used molecular docking methods and semi-empirical calculations for the study of interactions between the derivatives proposed by our group and the two enzymes. The realization of this study will serve as basis for the synthesis of most promising products, which in the future may lead to the creation of a prototype of an antiviral drug that contributes to the treatment of all forms of dengue, as well as in preventing it. | eng |
dc.contributor.advisor1 | Sant'Anna, Carlos Mauricio Rabello de | |
dc.contributor.advisor1ID | 827.232.227-72 | por |
dc.contributor.advisor-co1 | Kümmerle, Arthur Eugen | |
dc.contributor.referee1 | Souza, Aline Viana Coelho de | |
dc.contributor.referee2 | Silva, Robson Mariano da | |
dc.contributor.referee3 | Conceição Junior, Duilio Tadeu da | |
dc.contributor.referee4 | Barbosa, Maria Letícia de Castro | |
dc.creator.ID | 141.791.397-58 | por |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/7421907908670077 | por |
dc.publisher.country | Brasil | por |
dc.publisher.department | Instituto de Ciências Exatas | por |
dc.publisher.initials | UFRRJ | por |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Modelagem Matemática e Computacional | por |
dc.relation.references | BARBOSA, J. C., SANTOS, M. A. Modelagem Matemática, Perspectivas e Discussões. 2003. BASTOS, E. A. Otimização de Seções Retangulares de Concreto Armado Submetidas à FlexoCompressão Oblíqua Utilizando Algoritmos Genéticos. Tese de Mestrado, UFRJ, Rio de Janeiro, 2014. BENARROCH, D., EGLOFF, M.-P., MULARD, L., GUERREIRO, C., ROMETTE, J.-L., CANARD, B. J. Biol. Chem. 279, 35638-35643. 2004. CARTER, J. B; SAUNDERS, V. Virology – Principles and Applications. ISBN: 978-0-470-02386-0. 2007. CARVALHO, I., PUPO, M. T., BORGES, A. D. L., BERNARDES, L. S. C. Quim. Nova, Vol. 26, No. 3, 428-438, 2003. DEL CISTIA, C. N. Modelagem molecular aplicada ao estudo de reações de inibição enzimática com aplicação potencial no controle de Leishmania amazonensis. Tese de Doutorado. UFRRJ. 2010. EGLOFF, M. P., BENARROCH, D., SELISKO, B., ROMETTE, J. L., CANARD, B. EMBO J. 21, 2757–2768. 2002. GRANDI, TARCIANA. Estudos de Polimorfismos Genéticos e resposta ao Tratamento com Interferon-Alfa/Ribavirina em Pacientes com o Vírus da Hepatite C. p. 19-22, 2012. GUEX, N. AND PEITSCH, M.C. SWISS-MODEL and the Swiss-PdbViewer: An environment for comparative protein modeling. Electrophoresis 18, 2714-2723. 1997. HHMI. Disponível em: <http://www.hhmi.org/biointeractive/dengue-virus-life-cycle>. 2016. KAISER, Gabriele, SRIRAMAN, Bharath. A global survey of international perspectives on modelling in mathematics education. ZDM Vol. 38(3). 2006. LOPES, SUSANA I. O. Caracterização clínica e virológica do efeito do interferon peguilado e ribavirina no retratamento da hepatite C crónica em doentes récidivantes e não respondedores a tratamentos prévios de combinação. Porto, Portugal. p. 36-38, 2004. MARQUES, M. L., BOTTI, S. O que é e para que serve a Teoria dos Funcionais de Densidade? Disponível em: <http://nautilus.fis.uc.pt/gazeta/revistas/29_4/vol29_4_Art02.pdf>. 2007. MICHAELIS. Disponível em: < http://michaelis.uol.com.br/>. 2016. PORTAL DA SAÚDE. Disponível em <http://portalsaude.saude.gov.br/index.php/oministerio/principal/secretarias/svs/dengue>. 2016. MOPAC2016, James J. P. Stewart, Stewart Computational Chemistry, Colorado Springs, CO, USA. 2016. NELSON, D.L. & COX, M.M. Lehninger’s Principles of Biochemistry. 4ªed. New York: W. ISBN-10: 0716743396. ISBN-13: 978-0716743392. 2004. OLIVEIRA, André S., SILVA, Milene L. da, OLIVEIRA, Ana Flávia C. S. SILVA, Cynthia C. da, TEIXEIRA, Róbson R., DE PAULA, Sérgio O. NS3 and NS5 Proteins: Important Targets for Anti-Dengue Drug Design. J. Braz. Chem. Soc., Vol. 25, No. 10, 1759-1769, 2014. OLIVIERI, B. P. Otimização do Projeto de Pontes Protendidas Pré-Moldadas pelo Método dos Algoritmos Genéticos. Tese de Mestrado, UFRJ, Rio de Janeiro, 2004. PASCOAL, F. S., Sociedade Artificial Fight4life: Autômato Celular Modelando Vida Artificial. P. 11-37. 2005. PROSISE, G. L., WU, J., LUECKE, H. PDB ID: 1ME8. Journal: J.Biol.Chem. 277: 50654-50659. 2002. PDB ID: 1ME8. RITA, Mariane R., Otimização da Fase Construtiva de Estruturas de Concreto Massa em Ambiente Paralelo. 2015. ROSA, T. O., LUZ, H. S. Conceitos Básicos de Algoritmos Genéticos: Teoria e Prática. In: XI Encontro de Estudantes de Informática do Tocantins, 2009, Palmas. Anais do XI Encontro de Estudantes de Informática do Tocantins. Palmas: Centro Universitário Luterano de Palmas, 2009. p. 27-37. SANT’ANNA, C. M. R., Glossário De Termos Usados No Planejamento De Fármacos (Recomendações Da Iupac Para 1997). Quim. Nova, Vol. 25, No. 3, 505-512, 2002. SANT’ANNA, C. M. R., Métodos de modelagem molecular para estudo e planejamento de compostos bioativos: Uma introdução. Rev. Virtual Quim., 2009, 1 (1), 49‐57. Data de publicação na Web: 2 de Fevereiro de 2009. SCILAB ENTERPRISES. Disponível em: <http://www.scilab.org/>. 2015. SHATKIN, A. J. Capping of eucaryotic mRNAs. Cell, v. 9, n. 4, p. 645-653, 1976. STEWART, James J. P., Optimization of parameters for semiempirical methods V: Modification of NDDO approximations and application to 70 elements. Journal of Molecular Modeling. Volume 13, Issue 12, pp 1173-1213. 2007. STEWART, James J. P., Optimization of parameters for semiempirical methods VI: more modifications to the NDDO approximations and re-optimization of parameters. Journal of Molecular Modeling. Volume 19, Issue 1, pp 01-32. 2013. THE MATHWORKS, INC. Disponível em: <https://www.mathworks.com/?requestedDomain=www.mathworks.com>. 1994-2016. TORTORA, G. J FUNKE, B. R; CASE, C. L. Microbiologia. 10ª Ed. p. 367-395, 2010. University, USA, 1995. WAVEFUNCTION, INC. Disponível em < https://www.wavefun.com/>. 2016. WORLD HEALTH ORGANIZATION – WHO (2012). Dengue e Dengue hemorrágico. Nota descritiva, n. 117. Disponível em: <www.who.int/mediacentre/factsheets/fs117/es/>.2016. | por |
dc.subject.cnpq | Matemática | por |
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