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DC FieldValueLanguage
dc.contributor.authorPenedo, Diego Mattos
dc.date.accessioned2023-12-21T18:36:13Z-
dc.date.available2023-12-21T18:36:13Z-
dc.date.issued2020-07-30
dc.identifier.citationPENEDO, Diego Mattos. Análise fenotípica, citogenética e de genética molecular em macaco-prego-preto, Sapajus nigritus (Platyrrhini, Cebidae), em localidades dos estados do Rio de Janeiro e de São Paulo, Brasil. 2020. 101 f. Tese (Doutorado em Biologia Animal) - Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, 2020.por
dc.identifier.urihttps://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/9218-
dc.description.abstractO macaco-prego-preto, Sapajus nigritus, é um primata neotropical com ampla distribuição na Mata Atlântica, nos estados do sudeste e sul do Brasil e na província de Misiones, Argentina. A espécie apresenta diversidade fenotípica e genética, muitas vezes associadas a padrões biogeográficos. A coloração da pelagem varia de forma intraespecífica, sendo sugerida transição na predominância do padrão preto ao marrom, no sentido sul-norte da distribuição. Análises citogenéticas em populações da Argentina demonstram polimorfismo específico no par cromossômico 11. Enquanto na maioria das espécies de Sapajus esse par é o maior acrocêntrico, com grande bloco de heterocromatina extra-centromérica (HC) terminal, em S. nigritus, nessas populações, é descrita deleção total da HC. No entanto, o grande bloco de HC terminal já foi demonstrado em exemplares do Rio de Janeiro (RJ). Além da divergência cromossômica, dados filogenéticos demonstram parafilia entre amostras do RJ e de outras localidades ao longo da distribuição. Essas variações podem corresponder a um padrão de descontinuidade filogeográfica descrito na região de Mata Atlântica em São Paulo (SP), associado a refúgios florestais ocorridos no Pleistoceno. O objetivo deste estudo foi analisar a diversidade fenotípica e genética de S. nigritus em SP e RJ, averiguando os padrões de pelagem, a distribuição da HC no par 11 e a diversidade molecular no estado do RJ, comparando-a com outras localidades. Foram analisados indivíduos de cinco populações do estado do RJ: Ilha da Marambaia (IM), Reserva Biológica de Poço das Antas (RBPA), Parque Nacional do Itatiaia (PNI), da Tijuca (PNT) e da Serra dos Órgãos (PARNASO); além de exemplares ex situ de Guaratiba/RJ (Gua) e de cidades de São Paulo: capital (cSP), São José dos Campos (SJC), São Sebastião (SS), Paraibuna (PB) e Campos do Jordão (CJ). Espécimes de S. nigritus do Museu Nacional do Rio Janeiro (MNRJ), provenientes de Angra dos Reis, Itatiaia, Paraty e Teresópolis foram incluídos nas análises fenotípicas. Foi avaliada a coloração do dorso, ventre, membros, cauda e face. A presença e a distribuição de HC foram analisadas com técnicas de citogenética clássica e molecular. As relações filogenéticas foram inferidas com base nos genes mitocondriais citocromo c oxidase I, II e citocromo b, incluindo sequências disponíveis no GenBank®. Em 49 indivíduos capturados, seis ex situ e oito exemplares do MNRJ foram identificados os padrões de pelagem marrom (n=37) e preto (n=26), com variação intrapopulacional, predominando o preto à oeste (PNI e MNRJ) e marrom à leste (IM e PNT). A associação desse achado à predominância do padrão preto descrita em uma população de SP sugere um limite na variação preto-marrom na distribuição SP-RJ. O par 11 com a deleção da HC foi observado nas amostras à leste (IM, Gua, PNT, PARNASO e RBPA), enquanto à oeste ambos os padrões foram identificados, sem (cSP, CJ e SS) e com (SJC, PB e PNI) bloco de HC. Foi observada divergência molecular entre as amostras do RJ e aquelas de SP, PR e Argentina, incluindo o PNI, formando clados parafiléticos. A diversidade intraespecífica observada em S. nigritus pode representar unidades evolutivamente significativas (UES) e confirmar a região amostrada como um ponto de descontinuidade filogeográfica para a espécie.por
dc.description.sponsorshipCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal Rural do Rio de Janeiropor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.subjectFilogeografiapor
dc.subjectHeterocromatina constitutivapor
dc.subjectGenes mitocondriaispor
dc.subjectPhilogeographyeng
dc.subjectConstitutive heterochromatineng
dc.subjectMitochondrial geneseng
dc.titleAnálise fenotípica, citogenética e de genética molecular em macaco-prego-preto, Sapajus nigritus (Platyrrhini, Cebidae), em localidades dos estados do Rio de Janeiro e de São Paulo, Brasilpor
dc.title.alternativePhenotypic, cytogenetic and molecular genetic analysis in black-horned capuchin, Sapajus nigritus (Platyrrhini, Cebidae), from areas of Rio de Janeiro and São Paulo states, Brazileng
dc.typeTesepor
dc.description.abstractOtherThe black-horned capuchin, Sapajus nigritus, is a Neotropical primate with a wide distribution in the Atlantic Forest, from southeast Brazil to Misiones province, Argentina. The species presents phenotypic and genetic diversity, often associated with biogeographic patterns. The coat coloration varies with intraspecific differences, with transition in the predominance from black to brown pattern, in the south-north distribution. Cytogenetic analysis in populations from Argentina showed a specific polymorphism in the chromosome pair 11. While in most Sapajus’ species this pair is the largest acrocentric, with a terminal extracentromeric heterochromatic (HC) block, in S. nigritus, in these populations, the total deletion of HC is described. However, the terminal HC block has already been demonstrated in specimens from Rio de Janeiro (RJ). In addition to the chromosomal divergence, phylogenetic data demonstrate paraphyly among samples from RJ and other localities along the distribution. These variations may correspond to a pattern of phylogeographic discontinuity described in Atlantic Forest at São Paulo (SP), associated to forest refuges occurring in Pleistocene. The objective of this study was to analyze the phenotypic and genetic diversity of S. nigritus in SP and RJ, investigating the coat patterns, the distribution of HC in the par 11 and the molecular diversity in the state of RJ, comparing it with other localities. Individuals from five populations in the RJ state were analyzed: Ilha da Marambaia (IM), Reserva Biológica de Poço das Antas (RBPA), Parque Nacional do Itatiaia (PNI), da Tijuca (PNT) and da Serra dos Órgãos (PARNASO); as well as ex situ specimens from Guaratiba/RJ (Gua) and cities of São Paulo: capital (cSP), São José dos Campos (SJC), São Sebastião (SS), Paraibuna (PB) and Campos do Jordão (CJ). Specimens of S. nigritus at the Museu Nacional do Rio de Janeiro (MNRJ), from Angra dos Reis, Itatiaia, Paraty and Teresópolis, were included in the phenotypic analysis. Coloration of the back, belly, limbs, tail and face were evaluated. The presence and distribution of HC were analyzed using classical and molecular cytogenetic techniques. The phylogenetic relationships were inferred based on the mitochondrial genes cytochrome c oxidase I, II and cytochrome b, including sequences available in GenBank®. In 49 individuals captured, six ex situ and eight MNRJ specimens were identified brown (n=37) and black (n=26) coat patterns, with intrapopulation variation, predominating black to the west (PNI and MNRJ) and brown to the east (IM and PNT). The association of this finding with the predominance of the black pattern described in an SP population suggests a limit on the black-brown variation in the SP-RJ distribution. The pair 11 with the deletion of HC was observed in the samples to the east (IM, Gua, PNT, PARNASO and RBPA), while to the west both patterns were identified, without (cSP, CJ and SS) and with (SJC, PB and PNI) HC block. Molecular divergence was observed between the samples from RJ and those from SP, PR and Argentina, including the PNI, forming paraphyletic clades. The intraspecific diversity observed in S. nigritus may represent evolutionary significant units (ESU) and confirm the sampled region as a phylogeographic discontinuity point for the species.eng
dc.contributor.advisor1Nogueira, Denise Monnerat
dc.contributor.advisor1ID784.202.107-49por
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0121912784111761por
dc.contributor.advisor-co1Armada, Jorge Luís Azevedo de
dc.contributor.advisor-co1ID362.398.797-20por
dc.contributor.referee1Nogueira, Denise Monnerat
dc.contributor.referee2Verona, Carlos Eduardo da Silva
dc.contributor.referee3Silva, Hélio Ricardo da
dc.contributor.referee4Geise, Lena
dc.contributor.referee5Nieves, Mariela
dc.creator.ID112.386.377-60por
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3041817322482937por
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicas e da Saúdepor
dc.publisher.initialsUFRRJpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Biologia Animalpor
dc.relation.referencesAGUIAR, L.M. Os primatas do corredor do Alto Rio Paraná (região de Porto Rico, estados do Paraná e Mato Grosso do Sul): ocorrência, georreferenciamento e parâmetros populacionais. (Dissertação de Mestrado). Curitiba: Universidade Federal do Paraná. 2006. AMARAL, P.J.S.; FINOTELO, L.F.M.; DE OLIVEIRA, E.H.C.; PISSINATTI, A.; NAGAMACHI, C.Y.; PIECZARKA, J.C. Phylogenetic studies of the genus Cebus (Cebidae: Primates) using chromosome painting and G-banding. BMC Evolutionary Biology, 8(1): 169. 2008. AMARO, R.C.; RODRIGUES, M.T.; YONENAGA-YASSUDA, Y.; CARNAVAL, A.C. Demographic processes in the montane Atlantic rainforest: molecular and cytogenetic evidence from the endemic frog Proceratophrys boiei. Molecular Phylogenetics and Evolution, 62(3): 880-888. 2012. AQUINO, R. & ENCARNACIÓN, F. Population structure of Aotus nancymai (Cebidae: Primates) in Peruvian Amazon Lowland Forest. American Journal of Primatology, 11(1): 1-7. 1986. 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