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Tipo do documento: Tese
Title: Taxonomia e reclassificação de estirpes do gênero Azospirillum e Nitrospirillum pertencentes ao Centro de Recursos Biológicos Johanna Döbereiner
Other Titles: Taxonomy and reclassification of strains of the genus Azospirillum and Nitrospirillum belonging to the Johanna Döbereiner Center for Biological Resources
Authors: Ferreira, Natália dos Santos
Orientador(a): Zilli, Jerri Édson
Primeiro coorientador: Sant’anna, Fernando Hayashi
Primeiro membro da banca: Zilli, Jerri Édson
Segundo membro da banca: Coelho, Irene da Silva
Terceiro membro da banca: Reis, Veronica Massena
Quarto membro da banca: Bach, Evelise
Quinto membro da banca: Moreira, Fatima Maria de Souza
Keywords: Coleção de culturas;Novas espécies;Reclassificação taxonômica;Azospirillum;Nitrospirillum
Área(s) do CNPq: Agronomia
Idioma: por
Issue Date: 29-Nov-2022
Publisher: Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro
Sigla da instituição: UFRRJ
Departamento: Instituto de Agronomia
Programa: Programa de Pós-Graduação em Agronomia - Ciência do Solo
Citation: FERREIRA, Natália dos Santos. Taxonomia e reclassificação de estirpes do gênero Azospirillum e Nitrospirillum pertencentes ao Centro de Recursos Biológicos Johanna Döbereiner. 2022. 102 f. Tese (Doutorado em Agronomia - Ciência do Solo) - Instituto de Agronomia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, 2022.
Abstract: O Centro de Recursos Biológicos Johanna Döbereiner - CRB-JD, é uma coleção de culturas pertencente ao Centro Nacional de Pesquisa em Agrobiologia (CNPAB), existe oficialmente desde 1960, é mundialmente conhecido por manter uma alta diversidade de bactérias fixadoras de nitrogênio, além de conter espécies microbianas com potencial para serem utilizadas em benefício da sociedade brasileira. Hoje seu acervo abriga cerca de (53) leveduras, (64) fungos filamentosos, (6060) bactérias de diversos gêneros. Grande parte da Coleção foi identificada por meio de características bioquímicas e morfológicas. No entanto, com base nos métodos moleculares atualmente aceitos na análise do genoma, ainda faltam informações taxonômicas sobre as cepas. Diante disso, o presente trabalho propôs, por meio de análise molecular, caracterizar uma parte da coleção de germoplasma para os gêneros Azospirillum e Nitrospirillum. Ambos os gêneros possuem rizobactérias promotoras do crescimento vegetal com capacidade de fixar nitrogênio atmosférico e produzir compostos benéficos para as plantas e estão presentes em diferentes condições edafoclimáticas. As análises moleculares foram baseadas em caracterizações filogenéticas combinadas (16S rRNA, recA); genômica (identidade nucleotídica média (ANI) com valores de circunscrição de 96% e linha de corte de hibridização digital DNA-DNA (dDDH) de 70%, proteoma central). As análises funcionais são definidas apenas para as espécies de Azospirillum, são baseadas em caracterizações fenotípicas e bioquímicas. Este trabalho originou duas propostas de reclassificação taxonômica, definidas como Azospirillum baldaniorum Sp245T e Azospirillum argentinense Az39T , anteriormente classificadas como espécies pertencentes a Azospirillum brasilense. Além da classificação filogenética das cepas dos gêneros Azospirillum e Nitrospirillum, evidenciando a alta diversidade entre cepas das espécies de ambos os gêneros, sugerindo a existência de novas espécies e acrescentando informações ao banco de dados desta coleção de estirpes erroneamente classificadas pertencentes a outros gêneros.
Abstract: The Johanna Döbereiner Biological Resource Center - CRB-JD, is a culture collection belonging to the National Center for Research in Agrobiology (CNPAB), it has officially existed since 1960, it is world-renowned for maintaining a high diversity of nitrogen-fixing bacteria, in addition to containing microbial species that have the potential to be used for the benefit of Brazilian society. Today its collection houses about (53) yeasts, (64) filamentous fungi, (6060) bacteria of different genera. Much of the Collection was identified using biochemical and morphological features. However, based on currently accepted molecular methods in genome analysis, taxonomic information on the strains is still lacking. In view of this, the present work proposed, through molecular analysis, to characterize a part of the germplasm collection for the genus Azospirillum and Nitrospirillum. Both genera have plant growth-promoting rhizobacteria with the ability to fix atmospheric nitrogen and produce beneficial compounds for plants and are present in different edaphoclimatic conditions. Molecular analyzes were based on combined phylogenetic characterizations (16S rRNA, use of recA gene); genomics (average nucleotide identity (ANI) with circumscription values of 96% and DNA-DNA digital hybridization (dDDH) cut-line of 70%, core proteome). Functional analyses are defined only for Azospirillum species, are based on phenotypic and biochemical characterizations. This work originated two taxonomic reclassification proposals, defined as Azospirillum baldaniorum Sp245T and Azospirillum argentinense Az39T , previously classified as species belonging to Azospirillum brasilense. In addition to the phylogenetic classification of strains of the genus Azospirillum and Nitrospirillum, evidencing the high diversity between strains of the species of both genera, suggesting the existence of new species and adding information to the database of this collection of wrongly classified strains belonging to other genera.
URI: https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/20209
Appears in Collections:Doutorado em Agronomia - Ciência do Solo

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