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http://rima110.im.ufrrj.br:8080/jspui/handle/20.500.14407/24397| Tipo do documento: | Tese |
| Título : | Hibridação molecular e dimerização de farmacóforos como estratégias no planejamento de novos fármacos para o tratamento de infecções causadas por tripanossomatídeos |
| Otros títulos : | Molecular hybridization and dimerization of pharmacophore groups as strategies for designing new drugs to treat infections caused by trypanosomatids |
| Autor : | Velez, Afonso Santine Magalhães Mesquita |
| Orientador(a): | Lima, Marco Edilson Freire de |
| metadata.dc.contributor.advisor2: | Su, Bin |
| Primeiro coorientador: | Lima, Debora Decote Ricardo de |
| Primeiro membro da banca: | Lima, Marco Edilson Freire de |
| Segundo membro da banca: | Lima, Aurea Echevarria Aznar Neves |
| Terceiro membro da banca: | Kümmerle, Arthur Eugen |
| Quarto membro da banca: | Covre, Luciana Polaco |
| Quinto membro da banca: | Regasini, Luis Octavio |
| Palabras clave : | Piperina;Nitroimidazóis;Doença de Chagas;Doença do sono;Piperine;Nitroimidazoles;Chagas disease;Sleeping sickness |
| Área(s) do CNPq: | Química |
| Idioma: | por |
| Fecha de publicación : | 28-nov-2025 |
| Editorial : | Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro |
| Sigla da instituição: | UFRRJ |
| Departamento: | Instituto de Química |
| Programa: | Programa de Pós-Graduação em Química |
| Citación : | VELEZ, Afonso Santine Magalhães Mesquita. Hibridação molecular e dimerização de farmacóforos como estratégias no planejamento de novos fármacos para o tratamento de infecções causadas por tripanossomatídeos. 2025. 198 f. Tese (Doutorado em Química) - Instituto de Química, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, 2025. |
| Resumen : | As doenças causadas por protozoários tripanossomatídeos têm grande impacto na saúde pública em diferentes regiões do planeta e, até o momento, não dispõem de tratamentos adequados que garantam o bem-estar e a segurança dos pacientes durante os longos períodos de tratamento. Estando majoritariamente presente no continente americano, a doença de Chagas(tripanossomíase americana), causada pelo protozoário hemoflagelado Trypanosoma cruzi, afeta mais de 7 milhões de pessoas em todo o mundo. No continente africano, a doença do sono (trirpanossomíase humana africana), causada pelo Trypanosoma brucei, é um problema atual, visto que a mortalidade desta doença ocorre se não tratada no início de seus sintomas. No continente africano, mais de 55 milhões de pessoas vivem expostas em áreas endêmicas, em risco real de infecção. Considerando a demanda por desenvolvimento de novas alternativas terapêuticas para o tratamento dessas doenças, esse trabalho tem como foco principal o planejamento racional de novas moléculas por meio de duas abordagens distintas. No capítulo 1, trata-se do planejamento de moléculas híbridas, explorando o potencial de derivados sintéticos da amida natural piperina, extraídos dos frutos secos de Piper nigrum, juntamente com grupos farmacofóricos presentes em fármacos comerciais com atividade antiparasitária conhecida, como nitroimidazóis (presentes e responsáveis pela atividade antiparasitária dos fármacos benznidazol, megazol e metronidazol). Todas as moléculas sintetizadas foram avaliadas frente às principais formas morfológicas do T. cruzi, especialmente as formas amastigotas (cepa Tulahuen C2C4-LacZ), bem como frente ao T. brucei, e quanto à sua citotoxicidade em diferentes células de mamíferos. Além dos cálculos de docagem molecular, foram conduzidos cálculos em modelos enzimáticos de TcSDH e de 14DM de T. cruzi para investigar a capacidade inibitória da nova série de ligantes híbridos. Além da hibridação molecular, no Capítulo 2 realizou-se o planejamento racional de compostos diméricos inspirados unicamente no núcleo farmacofórico do benznidazol (2- nitroimidazol), gerados por meio de simples N-alquilações com agentes alquilantes bidentados, o que se mostrou uma estratégia promissora. A avaliação biológica demonstrou que todos os compostos dímeros foram ativos contra formas amastigotas de Trypanosoma cruzi (Tulahuen C2C4-LacZ). Notavelmente, os dímeros de cadeia mais longa exibiram potência notável (CI50 < 1,0 μM); isso confirmou que sua atividade anti- T. cruzi é dependente do tamanho da cadeia metilênica espaçadora, uma vez que os híbridos de cadeia mais longa interagem melhor com a nitroredutase do T. cruzi (TcNTR), que atua na ativação metabólica desses nitroimidazóis (pró-farmacos) no interior da célula do parasito. Esses compostos também mostraram atividade significativa contra T. b. brucei (T. b. brucei 427) e citotoxicidade muito baixa em células de mamíferos, destacando sua seletividade, especialmente em relação aos dímeros de cadeia mais longa. Esses grupos farmacofóricos nitroimidazólicos são de fundamental importância na terapia dessas doenças antiparasitárias, que, apesar de sua baixa eficácia, é uma das poucas que ainda conseguem ter êxito em alguma etapa do tratamento. Todos os compostos de ambas as séries foram caracterizados por IV, RMN 1H e 13C, bem como HRMS. Esse estudo em sua totalidade visa trazer à luz um melhor entendimento do seu funcionamento frente aos diferentes parasitos e hospedeiros, em diferentes abordagens, a fim de promover um melhoramento em sua aplicação nas estruturas de novos candidatos a fármacos, ajudando a desmistificar sua aplicação no desenvolvimento de novos candidatos a protótipos de moléculas com atividade frente a doenças infecciosas parasitárias. |
| Abstract: | Diseases caused by trypanosomatid protozoa significantly impact public health worldwide, and effective long- term treatments are still lacking. Predominantly found in the Americas, Chagas disease (American trypanosomiasis), caused by the hemoflagellated protozoan Trypanosoma cruzi, affects over 7 million people globally. In Africa, sleeping sickness (Human African trypanosomiasis), caused by Trypanosoma brucei, remains a serious health threat because of its high fatality rate if not treated early. Over 55 million people live in endemic zones across Africa, facing real risks of infection. Due to the urgent need for new therapeutic options, this work emphasizes the rational design of novel molecules using two approaches. Chapter 1 details the design of hybrids based on synthetic derivatives of the natural amide piperine, extracted from dried Piper nigrum fruits, combined with pharmacophoric groups found in existing antiparasitic drugs like nitroimidazoles (which contribute to the activity of benznidazole, megazol, and metronidazole). All molecules were tested against the primary forms of T. cruzi, especially the amastigote stage (strain Tulahuen C2C4- LacZ), and evaluated for activity against T. brucei and cytotoxicity toward different mammalian cells. Molecular docking and enzymatic models of TcSDH and 14 DM of T. cruzi were used to assess the inhibitory potential of these hybrid ligands. In Chapter 2, the rational design of dimeric compounds was explored, inspired solely by the pharmacophoric core of benznidazole (2- 2- nitroimidazole), created through simple N-alkylation using bidentate alkylating agents — a promising strategy. Biological tests showed all dimeric compounds were active against T. cruzi amastigotes (Tulahuen C 2 C 4- LacZ). Notably, longer-chain dimers displayed remarkable potency (IC50 < 1 1.0 μM), indicating that their activity depends on the length of the methylene spacer; longer chains interact more effectively with T. cruzi nitroreductase (TcNTR), which activates these prodrugs inside the parasite. These compounds also demonstrated significant activity against T. b. brucei (strain 427) and exhibited minimal cytotoxicity in mammalian cells, underscoring their selectivity — especially among the longer-chain dimers. The nitroimidazole pharmacophoric groups are crucial in antiparasitic therapy, which, despite limited efficacy, continues to show some success at certain stages of treatment. All the compounds in both series were characterized by IR, 1H and 13C NMR, as well as HRMS. Overall, this study aims to enhance understanding of their mechanisms of action across different parasites and hosts. It uses multiple approaches to improve the design of new drug candidates and facilitate the development of prototype molecules active against parasitic infections. |
| URI : | http://rima110.im.ufrrj.br:8080/jspui/handle/20.500.14407/24397 |
| Aparece en las colecciones: | Doutorado em Química |
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