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https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/18513
Tipo do documento: | Tese |
Título: | Identificação molecular de coccídios de aves silvestres: aplicabilidade de algumas regiões gênicas mitocondriais na diferenciação de espécies e análise filogenética |
Otros títulos: | Molecular identification of coccidia of wild birds: applicability of some mitochondrial gene regions in species differentiation and phylogenetic analysis |
Autor: | Mello, Ericson Ramos de |
Orientador(a): | Berto, Bruno Pereira |
Primeiro coorientador: | Lima, Viviane Moreira de |
Primeiro membro da banca: | Berto, Bruno Pereira |
Segundo membro da banca: | Oliveira, Mariana de Souza |
Terceiro membro da banca: | Santos-Clapp, Michelle Daniele dos |
Quarto membro da banca: | Cardozo, Sergian Vianna |
Quinto membro da banca: | Dias, Lúcio André Viana |
Palabras clave: | biologia molecular;coccídios;COI;18S;Isospora;molecular biology;coccidia;COIx |
Área(s) do CNPq: | Parasitologia |
Idioma: | por |
Fecha de publicación: | 26-jun-2023 |
Editorial: | Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro |
Sigla da instituição: | UFRRJ |
Departamento: | Instituto de Veterinária |
Programa: | Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias |
Citación: | MELLO, Ericson Ramos de. Identificação molecular de coccídios de aves silvestres: aplicabilidade de algumas regiões gênicas mitocondriais na diferenciação de espécies e análise filogenética. 2023. 235 f. Tese (Doutorado em Ciências, Ciências Veterinárias) - Instituto de Veterinária, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, 2023. |
Resumen: | Os coccídios são protozoários intracelulares obrigatórios que infectam a maioria dos invertebrados, todas as classes dos vertebrados, incluindo os animais domésticos, silvestres e seres humanos. Apresentam ciclos de vida intestinais, embora sejam observados, em algumas espécies, estágios de vida extra-intestinais. São geralmente identificados a partir de amostras fecais. O Brasil apresenta uma diversa avifauna representada atualmente por 1.971 espécies de diferentes ordens, dentre as quais destacam-se os Passeriformes, ordem mais representativa que é frequentemente positiva para diferentes espécies de coccídios parasitas, principalmente dos gêneros Isospora Schneider, 1881 e Eimeria Schneider, 1875. O estudo das interações entre esses parasitos e hospedeiros nos permite entender diversos processos ecológicos, evolutivos e comportamentais, incluindo seleção sexual, sucesso reprodutivo, migração, competitividade, dentre outras. Atualmente, existem diversas técnicas e metodologias que podem ser aplicadas para identificação de uma espécie coccidiana além da análise morfológica, desde a confirmação da suscetibilidade do hospedeiro, determinação da densidade parasitária, grau de patogenicidade e identificação de diferenças inter e intra-específicas que fornecem ajustes taxonômicos relevantes. Finalmente, o advento da Biologia Molecular, prática reconhecida e estabelecida, principalmente no estudo de parasitas coccidianos dos animais de produção, oferece informações complementares as de microscopia e métodos imunológicos, por exemplo, pois o sequenciamento do DNA do microrganismo, serve como estudo adicional para a taxonomia e filogenia. Baseando-se nestes fatos, este trabalho, nos capítulos I, II, III e IV teve por objetivos, identificar geneticamente coccídios parasitas de aves silvestres capturadas em regiões de Mata Atlântica do Sudeste brasileiro, demonstrando o isolamento de oocistos de coccídios de amostras fecais de aves silvestres, com posterior extração de DNA a fim de amplificar e sequenciar diferentes regiões gênicas dos genes cox1, cox3 e fragmentos da subunidade pequena e grande do rDNA do DNA mitocondrial, avaliando a aplicabilidade destas novas sequências na diferenciação de espécies e estudos filogenéticos. |
Abstract: | Coccidia are obligate intracellular protozoa that infect most invertebrates, all classes of vertebrates, including domestic, wild, and human animals. They have intestinal life cycles, although extra-intestinal life stages are observed in some species. They are usually identified from fecalsamples. Brazil has a diverse avifauna currently representd by 1.971 species of different orders, among which the Passeriformes stand out, a more representative order that is often positive for different species of parasitic coccidia, mainly of the genera Isospora Schneider, 1881 and Eimeria Schneider, 1875. The study of the interactions between these parasites and hosts allows us to understand several ecological, evolutionary and behavioral processes, including sexual selection, reproductive success, migration, competitiveness, among others. Currently, there are several techniques and methodologies that can be applied to the identification of a coccidian species beyond morphological analysis, from the confirmation of host susceptibility, determination of parasite density, degree of pathogenicity and identification of inter- and intra-specific differences that provide relevant taxonomic adjustments. Finally, the advent of Molecular Biology, a recognized and established practice, especially in the study of coccidian parasites of production animals, offers complementary information to that of microscopy and immunological methods, for example, because the sequencing of the DNA of the microorganism, serves as an additional study for taxonomy and phylogeny. Based on these facts, this work, in chapters I, II, III and IV, aimed to identify genetically parasitic coccidia of wild birds captured in Atlantic Forest regions of Southeastern Brazil, demonstrating the isolation of coccidia oocysts from fecal samples of wild birds, with subsequent DNA extraction in order to amplify and sequence different gene regions of cox1, cox3 and fragments of the small and large rDNA subunit of mitochondrial DNA genes, evaluating the applicability of these new sequences in species differentiation and phylogenetic studies. |
URI: | https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/18513 |
Aparece en las colecciones: | Doutorado em Ciências Veterinárias |
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