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Tipo do documento: Dissertação
Título: Estimativa de Parâmetros Genéticos via REML/Blup Visando a Seleção de Genótipos Superiores de Melão-de-são-caetano (Momordica charantia) para a Produção de Frutos
Título(s) alternativo(s): Estimation of Genetic Parameters by REML/Blup Aiming at Selection of Superior Genotypes of Bitter Gourd (Momordica charantia) for Fruit Production
Autor(es): Marques, Mayara de Mello
Orientador(a): Damasceno Junior, Pedro Corrêa
Primeiro membro da banca: Damasceno Junior, Pedro Corrêa
Segundo membro da banca: Trindade, Roberto dos Santos
Terceiro membro da banca: Menezes, Bruna Rafaela da Silva
Palavras-chave: Modelos mistos;Parâmetros genéticos;Plantas medicinais;Melhoramento de plantas;Blup-PCA;Mixed models;Genetic parameters;Medicinal plants;Plant improvement
Área(s) do CNPq: Engenharia Agrícola
Idioma: por
Data do documento: 29-Abr-2021
Editor: Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro
Sigla da instituição: UFRRJ
Departamento: Instituto de Agronomia
Programa: Programa de Pós-Graduação em Fitotecnia
Citação: MARQUES, Mayara de Mello. Estimativa de Parâmetros Genéticos via REML/Blup Visando a Seleção de Genótipos Superiores de Melão-de-são-caetano (Momordica charantia) para a Produção de Frutos. 2021. 63 f. Dissertação (Mestrado em Fitotecnia) - Instituto de Agronomia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, 2021.
Resumo: O melão-de-são-caetano (Momordica charantia) é uma cucurbitácea, monóica, diplóide, com 2n=2x=22 cromossomos, conhecida por sua ação hipoglicêmica. Apesar da sua importância, o melhoramento do melão-de-são-caetano ainda é incipiente. Diante disso, estudos relativos a herança de características ligadas a produção são de suma importância para se conhecer o germoplasma disponível e para se buscar as melhores estratégias para o processo de seleção de genótipos superiores. Neste sentido, a estimação de parâmetros genéticos via método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML) e a estimação dos valores fenotípicos dos genótipos via Melhor Preditor Linear Não-Viesado (Blup) se constituem em importantes ferramentas para a seleção de genótipos de melão-de-são-caetano com performance agronômica superior. Dessa forma, os objetivos do presente trabalho foram conhecer a herança de 17 variáveis ligadas a produção de frutos em melão-de-são-caetano, bem como selecionar genótipos com alta performance para a produção de frutos na cultura. Neste trabalho, também foi proposto associar o Blup com o PCA (Análise de Componentes Principais), cujo objetivo foi permitir uma interpretação simultânea dos valores fenotípicos dos genótipos considerando todas as variáveis num mesmo plano bidimensional. Diante disso, foram plantados 22 genótipos de melão-de-são-caetano em vasos de 18 litros contendo substrato apropriado, organizados em casa de vegetação. As plantas foram analisadas quanto a 17 variáveis relativas ao número, tamanho, peso total e peso médio de frutos e de sementes, bem como o peso total e médio do arilo das sementes, durante um ciclo completo de produção. Estimaram-se coeficientes de correlação entre as variáveis, e para cada uma delas, via REML, estimaram-se parâmetros descritivos, variâncias, repetibilidades e acurácias. Os valores fenotípicos e o ranqueamento dos genótipos foram obtidos via Blup. Estes valores foram submetidos a análise de PCA. Modelos de regressão foram ajustados para os melhores genótipos considerando o número de frutos por planta (NFP). Em suma, os coeficientes de repetibilidade estimados foram classificados como baixos para a maioria das variáveis. A variável NFP foi a mais promissora para ganhos genéticos, já que ela apresentou uma das maiores correlações com a produção total (= frutos + sementes + arilo), aliado a sua vi estimativa de repetibilidade individual (r = 0,47). Esta estimativa (r) é razoável para culturas ainda não melhoradas e para variáveis altamente quantitativas. Verificou-se uma correlação baixa entre a produção de frutos e o tamanho dos frutos. Porém, foi possível identificar genótipos produtivos contendo frutos maiores. Este foi o caso dos genótipos UFRRJ MSC028 e UFRRJ MSC087. Vale ressaltar que, o genótipo mais produtivo produziu 146 frutos, e o menos produtivo, apenas quatro frutos. Os genótipos mais bem ranqueados para a produção de frutos, via Blup-PCA, foram: UFRRJ MSC028, UFRRJ MSC042, UFRRJ MSC044, UFRRJ MSC053, UFRRJ MSC072 e UFRRJ MSC087. O comportamento da variável NFP dos genótipos em destaque se ajustou ao modelo cúbico de regressão. Porém, a depender do genótipo, os pontos de inflexão das curvas (picos de produção) ocorreram em momentos distintos no ciclo de produção. Os genótipos mencionados anteriormente foram elencados como potenciais progenitores femininos no programa de melhoramento do melão-de-são-caetano na UFRRJ.
Abstract: The bitter gourd (Momordica charantia) is a cucurbitaceous, monoecious, diploid, with 2n=2x=22 chromosomes, known for its hypoglycemic action. Despite its importance, the improvement of the bitter gourd is still in its incipient. Therefore, studies on the inheritance of traits linked to production are in show high importance to know the available germplasm and to seek the best strategies for the selection process of superior genotypes. In this aspect, the estimation of genetic parameters by the Restricted Maximum Likelihood (REML) method, and the estimation of the phenotypic values of the genotypes by the Best Linear Unbiased Predictor (Blup) are important tools for the selection of bitter gourd genotypes with superior agronomic performance. Thus, the objectives of the present work were to know the inheritance of 17 traits linked to fruit production in bitter gourd, as well as to select genotypes with high performance for the production of fruits in the crop. In this work, it was also proposed to associate Blup with PCA (Principal Component Analysis), whose objective was to allow a simultaneous interpretation of the phenotypic values of the genotypes considering all the variables in the same two-dimensional plane. Therefore, 22 bitter gourd genotypes were planted in 18 liter vases containing appropriate substrate, organized in a greenhouse. Plants were analyzed for 17 traits related to number, size, total and average weight of fruits and seeds, as well as total and average seed aril weight, during a completed production cycle. Correlation coefficients between these traits were estimated, and for each of them, by REML, descriptive parameters, variances, repeatability and accuracy were estimated. The phenotypic values and genotype ranking were obtained by Blup. These values were subjected to PCA analysis. Regression models were fitted to the best genotypes, considering the number of fruits per plant (NFP). Summing up, the estimated repeatability coefficients were classified as low for most traits. The trait NFP was the most promising for genetic gains, as it showed one of the highest correlations with total production (= fruits + seeds + aril), combined with its estimate of individual repeatability (r = 0.47). This estimate (r) is reasonable for unimproved crops and for highly quantitative traits. It was verified a low correlation between viii fruit yield and fruit size. However, it was possible to identify productive genotypes containing larger fruits. This was the case for the UFRRJ MSC028 and UFRRJ MSC087 genotypes. It is noteworthy that the most productive genotype produced 146 fruits, and the least productive, only four fruits. The best ranked genotypes for fruit production, by Blup- PCA, were: UFRRJ MSC028, UFRRJ MSC042, UFRRJ MSC044, UFRRJ MSC053, UFRRJ MSC072 and UFRRJ MSC087. The behavior of the NFP variable of the highlighted genotypesfit the cubic regression model. However, depending on the genotype, the inflection points of the curves (production peaks) occurred at different times in the production cycle. The genotypes mentioned above were listed as potential female parents in the bitter gourd breeding program at UFRRJ.
URI: https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/22705
Aparece nas coleções:Mestrado em Fitotecnia

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