Diagnóstico da otite externa em cães: comparação entre o microbioma auricular e cultura bacteriana.

Abstract

A otite externa canina é a doença auricular mais comum em cães, afetando aproximadamente 20% da população, e ocorre quando há desequilíbrio no microambiente da orelha. O uso indiscriminado de antimicrobianos no tratamento das otites contribui para a seleção de cepas resistentes, dificultando a efetividade do tratamento. O objetivo deste estudo foi analisar a microbiota presente em cães com otite externa e compará-la com os dados obtidos nas culturas bacterianas. Foram coletadas amostras de 48 cães diagnosticados com otite externa durante consultas em clínicas particulares, totalizando 106 swabs de orelhas. As amostras foram coletadas em duplicata, com uma destinada para cultura bacteriana, inoculados em Ágar Sangue de Carneiro 5% e Ágar Eosina-Azul de Metileno, e outra para extração de DNA. Após

purificação, os isolados foram identificados por métodos fenotípicos, incluindo o MALDI- TOF-MS. Ao todo, foram obtidos 125 isolados, pertencentes a 33 gêneros/espécies bacterianas,

e os testes de sensibilidade aos antimicrobianos foram realizados por meio da técnica de disco- difusão. Ao total, 42 amostras atenderam aos critérios de qualidade e puderam ser sequenciadas.

A análise de abundância revelou que os gêneros Staphylococcus e Corynebacterium destacaram-se nas populações otológicas. A beta-diversidade indicou uma correlação significativa entre diferentes raças, agrupando pelo menos dois grupos com comunidades microbianas similares. As 40 amostras sequenciadas permitiram a comparação dos dados com os resultados do isolamento bacteriano (55). Comparando os resultados, foi possível observar que 7,27% (4/55) dos isolados bacterianos não apareceram no sequenciamento. Em 30,91% (17/55) das amostras, a cultura foi compatível com o gênero mais abundante no microbioma, e em 61,82% (34/55) dos cultivos, o resultado da cultura não foi compatível com o microrganismo mais abundante no sequenciamento. Deste último, em 50,90% (28/55) dos casos, o sequenciamento mostrou que existiam gêneros cultiváveis mais abundantes do que aqueles encontrados na cultura. Em 29,09% (16/55) das amostras, as bactérias mais abundantes eram anaeróbias. Em metade dos casos, populações de bactérias cultiváveis mais abundantes não foram isoladas, levantando dúvidas sobre a capacidade das culturas em detectar o agente infeccioso real da otite e se são representativas para a análise terapêutica por antibiograma. Dessa forma, podemos concluir que as culturas bacterianas de otite nem sempre conseguem detectar a população bacteriana mais abundante. Além disso, os resultados indicaram evidências de que o microbioma possui uma dinâmica própria e que o tratamento pode impactar a diversidade da comunidade bacteriana.